Oftest pseudomembranøs kolitt utvikler seg under påvirkning av langvarig bruk av antibiotika ampicillin, lincomycin, Klinda-mitsina, cefalosporiner, minst - penicillin, erytromycin, kloramfenikol, tetracyklin. Clostridium difficile - sporedannende Gram-positive anaerobe Bacillus, som er i stand til å fremstille to typer av eksotoksiner toksin A og toksin B. Det er fire hovedgrunner for utvikling av pseudomembranøs kolitt assosiert med C. Difficile.