På sykehus varer behandlingen av ukompliserte magesår 20–30 dager, og for duodenalsår – 10 dager. Ved utskrivelse fra sykehuset får pasienten et juridisk bindende dokument (et utdrag fra sykehistorien), som angir den fullstendige diagnosen av sykdommen og individuelle kjennetegn ved sykdommen (lokalisering og størrelse av magesåret, komplikasjoner av magesår, tidligere operasjoner for magesår, behandlingsanbefalinger), og registrerer også samtidige sykdommer av magesåret.