Behandling av cerebrale abscesser kan være konservativ og kirurgisk. Behandlingsmetoden avhenger hovedsakelig av utviklingsstadiet av abss, dets størrelse og lokalisering. I fase av dannelsen av encefalitisk fokus (varigheten av anamnese er opptil 2 uker), samt med små (<3 cm i diameter) abscesser, er konservativ behandling indisert.