Behandling av meningokokkinfeksjon avhenger av sykdommens kliniske form. Med nasofaryngitt er terapi symptomatisk. Dersom diagnosen er bekreftet bakteriologisk brukte benzylpenicillin, ampicillin, cefalosporiner I-II generasjon, kloramfenikol, pefloxacin sekundære terapeutiske doser i løpet av 3 dager. Bruk ikke co-trimoxazol, aminoglykosider, som de fleste eksisterende menokokokstammer er stabile for.