Med medfødt cytomegalovirusinfeksjon avhenger arten av det berørte fosteret av infeksjonens varighet. Akutt cytomegalovirus infeksjon hos mor i de første 20 ukene av svangerskapet kan føre til alvorlig sykdom hos fosteret, hvor resultatet er spontan abort, fosterdød, mortvorozhdenie, defekter, i de fleste tilfeller, uforenlig med liv. Når infeksjon med cytomegalovirus i sen graviditet, er prognosen for liv og normal utvikling av barnet gunstigere.