EEG-analyse utføres under opptaket og til slutt etter at det er fullført. Under opptaket vurderes tilstedeværelsen av artefakter (induksjon av nettverksstrømfelt, mekaniske artefakter av elektrodebevegelse, elektromyogram, elektrokardiogram, etc.), og det iverksettes tiltak for å eliminere dem. Frekvensen og amplituden til EEG vurderes, karakteristiske grafiske elementer identifiseres, og deres romlige og tidsmessige fordeling bestemmes.