MR evaluerer tilstanden til hjernestrukturer basert på omriss, størrelse og vevstetthet. Det er viktig å merke seg at MR gjenspeiler vevstetthet avhengig av vanninnholdet, og derfor primært identifiserer slike lesjoner som cerebralt ødem-hevelse (CED), demyeliniserende sykdommer og svulster.