Bestemmelse av X- og Y-kromatin kalles ofte en metode for ekspressdiagnostikk av kjønn. Cellene i munnslimhinnen, vaginalepitelet eller hårsekken undersøkes. I kjernen til kvinnelige celler er det to X-kromosomer tilstede i det diploide settet, hvorav ett er fullstendig inaktivert (spiralisert, tettpakket) allerede i de tidlige stadiene av embryonal utvikling og er synlig som en klump av heterokromatin festet til kjernemembranen.